肝囊肿手术虽属较成熟的外科操作，但仍存在一定风险，术前需充分了解。术中常见风险包括出血，因肝脏血供丰富，若囊肿位置深或邻近大血管，手术中可能损伤血管导致出血，严重时需输血甚至二次手术止血。此外，可能误伤邻近器官，如胆囊、胃肠道或膈肌，尤其当囊肿与周围组织粘连紧密时，器官损伤风险增加，可能引发相应功能异常。术后并发症中，感染较常见，包括切口感染、腹腔内感染，免疫力低下或合并糖尿病者风险更高，可能需抗生素治疗或引流。胆瘘也是需关注的问题，若手术中损伤肝内胆管，胆汁漏入腹腔可引起腹痛、发热，严重时需穿刺引流或再次手术修复。部分患者还可能出现囊肿复发，尤其是多发性囊肿或囊壁切除不彻底时，囊肿可能再次增大。对于老年人、合并高血压、肝硬化等基础疾病者，手术耐受性较差，可能增加心脑血管意外、肝肾功能损害等风险。术前需与医生充分沟通，评估身体状况，明确风险后再决定是否手术。